Πολλοί εκπαιδευτικοί συμμετέχουν στα προγράμματα συνεργασίας του Μουσικού Σχολείου Ludwig van Beethoven και διδάσκουν σε νηπιαγωγεία και κέντρα ημερήσιας φροντίδας, σε δημοτικά σχολεία και σε ανοιχτές ολοήμερες εγκαταστάσεις (OGS), καθώς και σε σχολεία δευτεροβάθμιας εκπαίδευσης.
Με τα προγράμματα συνεργασίας του, το Μουσικό Σχολείο Ludwig van Beethoven ανταποκρίνεται στη μεταβαλλόμενη πραγματικότητα της ζωής των οικογενειών: πολλά παιδιά ηλικίας νηπιαγωγείου ή δημοτικού φροντίζουν πλέον μέχρι αργά το απόγευμα σε παιδικούς σταθμούς και ολοήμερες δομές ή είναι δεσμευμένα στο σχολείο.
Τα προγράμματα συνεργασίας επιτρέπουν επίσης την πολιτιστική συμμετοχή παιδιών που έχουν δυσκολότερη πρόσβαση στην πολιτιστική εκπαίδευση λόγω της κοινωνικοοικονομικής τους κατάστασης.
Κατά το σχολικό έτος 2024/2025, 1900 μαθητές του Μουσικού Σχολείου Ludwig van Beethoven θα διδαχθούν σε προγράμματα συνεργασίας, εκ των οποίων 1600 μόνο στο εκπαιδευτικό πρόγραμμα JeKits. Οι εταίροι του μουσικού σχολείου περιλαμβάνουν παιδικούς σταθμούς και κέντρα ημερήσιας φροντίδας, εγκαταστάσεις OGS και σχολεία δευτεροβάθμιας εκπαίδευσης.
Στα προγράμματα συνεργασίας μπορούν να συμμετέχουν μόνο τα παιδιά που φοιτούν στα αντίστοιχα ιδρύματα. Τα συνεργαζόμενα ιδρύματα ενημερώνουν τους γονείς για το περιεχόμενο και το εύρος των προγραμμάτων καθώς και για τις ώρες κατά τις οποίες είναι δυνατή η εγγραφή.